Омский НПЗ в 2012 году увеличил объем переработки нефти на 5% по сравнению с 2011 годом — до 20,95 млн тонн. Глубина переработки нефти в 2012 году составила 88,83% — этот показатель является одним из лучших в отрасли.

Выпуск автомобильных бензинов на ОНПЗ вырос на 14,5% ≈ до 4,7 млн тонн. Доля производства высокооктановых бензинов составила 88% ≈ на 2% выше показателей 2011 года.

Судовых топлив произведено 3,2 млн тонн, что более чем в полтора раза превышает показатели 2011 года. Производство керосина выросло на 8,2% ≈ до 1,5 млн тонн.

В 2012 году на заводе был поэтапно введен в эксплуатацию комплекс гидрооблагораживания моторных топлив, включающий установку гидроочистки бензинов каталитического крекинга и установку гидроочистки дизельного топлива. Это позволило заводу увеличить выпуск бензинов 4 и 5 экологических классов до 2,38 млн тонн, что более чем в 30 раз выше показателей 2011 года, а также начать производство дизельного топлива 4 и 5 классов.

Всемирная ассоциация нефтеперерабатывающих компаний (WRA) в 2012 году признала Омский НПЗ "Газпром нефти" лучшим нефтеперерабатывающим заводом России и стран СНГ, высоко оценив проекты, реализованные на Омском нефтеперерабатывающем заводе в рамках программы модернизации до 2020 года.

В 2012 году продукция Омского НПЗ вновь победила в конкурсе "Сто лучших товаров России". Дипломов лауреатов удостоены: бензин автомобильный Супер Евро-98, битум нефтяной дорожный вязкий БНД 90/130. Дипломантами в номинации "Продукция производственно-технического назначения" стали: бензин автомобильный неэтилированный Регуляр-92; бензол нефтяной высшей очистки; топливо дизельное летнее; судовое маловязкое топливо СМТ (DMA).